axmd/2026/soft_install/CREST_install.md

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在macOS上安装CREST（m1 Pro）	2026-05-02	CREST install	软件安装，模拟	安装CREST

介绍：CREST

CREST 是一个开源的小分子构象与势能面自动探索工具，基于 xTB 作为能量评估引擎，利用 metadynamics 等采样方法自动搜索分子的低能构象空间，生成按能量排序的构象集合及其 Boltzmann 分布，从而无需人为指定扫描坐标即可系统性地覆盖分子的柔性构象与局部势能面，广泛用于药物分子构象生成、虚拟筛选预处理以及后续高精度量化计算的初始结构准备。

安装，使用mamba

mamba create -n crest
mamba activate crest
mamba install  crest -y


# 其他辅助包 openbabel 不能高于3.12 2026-05-02
mamba install rdkit openbabel python=3.12 -y

使用crest进行势能面搜索

先用rdkit生成构象。